Kaito est un nouvel élève de l'établissement privé Root Academy. Adorant résoudre des puzzles, il est sélectionné comme candidat au "Phi Brain" pour ses extraordinaires capacités intellectuelles. Un jour, lui et son amie d'enfance Nonoha s'attaquent au fameux "Puzzle irrésoluble" caché dans les ruines souterraines près de l'école. Ils sont guidés par un appareil que le président du conseil des élèves a donné à Kaito. Cependant ce puzzle s'avère être le dangereux Puzzle du Sage crée par l'organisation maléfique POG. C'est le début des batailles de puzzles contre POG.
Site officiel : http://www.nhk.or.jp/anime/phibrain/
Equipe du projet :
Création originale : Hajime YATATE (矢立肇 - pseudonyme collectif représentant le staff de Sunrise)
Réalisation : Junichi SATO (佐藤順一 - Aria, Kaleido Star, Princess Tutu)
Structure scénaristique : Mayori SEKIJIMA (関島眞頼 - The SoulTaker, Kaze no Stigma)
Production de l'animation : Sunrise

Sources : ANN, dtshyk sur le forum myanimelist & site du Newtype